Tijdens de Koude Oorlog speelde Fort Pannerden een belangrijke rol als onderdeel van de Nederlandse verdedigingslinie. Het diende als strategisch punt om de toegang tot de Rijn te bewaken en mogelijk vijandelijke invallen te weerstaan. Het fort fungeerde als een belangrijke schakel in de verdediging van Nederland tegen een mogelijke aanval uit het oosten, met name vanuit het voormalige Warschaupact, waaronder de Sovjet-Unie. Hoewel de Koude Oorlog nooit tot een open conflict tussen Oost en West heeft geleid, bleef Fort Pannerden een belangrijk onderdeel van de verdedigingsstructuur van Nederland gedurende deze periode.